Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SNCBQ16143 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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SNCBQ16143 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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