Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USF2Q15853 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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USF2Q15853 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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USF2Q15853 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
USF2Q15853 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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USF2Q15853 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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