Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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