Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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HERC3Q15034 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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HERC3Q15034 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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HERC3Q15034 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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HERC3Q15034 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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