Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GAPVD1Q14C86 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GAPVD1Q14C86 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms