Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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CHD4Q14839 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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CHD4Q14839 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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CHD4Q14839 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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CHD4Q14839 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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