Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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