Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms