Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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SCARB2Q14108 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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