Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
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