Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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