Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PRPF4BQ13523 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms