Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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