Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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