Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ITGB3BPQ13352 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms