Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCGQ13326 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms