Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms