Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms