Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CPSF1Q10570 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CPSF1Q10570 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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