Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms