Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPREP23469 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPREP23469 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPREP23469 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPREP23469 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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