Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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PTPRAP18433 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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PTPRAP18433 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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PTPRAP18433 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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PTPRAP18433 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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