Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SOBPA7XYQ1 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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