Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRPF3Q9ULD4 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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