Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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HOXC10Q9NYD6 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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HOXC10Q9NYD6 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXC10Q9NYD6 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXC10Q9NYD6 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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