Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FANCFQ9NPI8 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms