Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMG1Q96Q15 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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