Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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UBXN4Q92575 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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UBXN4Q92575 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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UBXN4Q92575 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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UBXN4Q92575 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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