Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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ZBED9Q6R2W3 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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