Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BBS9Q3SYG4 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BBS9Q3SYG4 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms