Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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