Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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