Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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