Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms