Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms