Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms