Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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