Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
USF2Q15853 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
USF2Q15853 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USF2Q15853 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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