Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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