Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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