Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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SCARB2Q14108 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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SCARB2Q14108 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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SCARB2Q14108 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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SCARB2Q14108 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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SCARB2Q14108 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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SCARB2Q14108 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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SCARB2Q14108 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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