Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
APOFQ13790 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
APOFQ13790 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
APOFQ13790 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
APOFQ13790 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
APOFQ13790 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
APOFQ13790 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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