Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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