Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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