Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRR1Q13601 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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