Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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