Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SP140Q13342 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SP140Q13342 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SP140Q13342 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SP140Q13342 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SP140Q13342 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SP140Q13342 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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