Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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