Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms