Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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